Привет, а чем редактируете?
Каким редактором?

Файлы .yml нужно редактировать соблюдая yml синтаксис, в блокноте это сделать вряд-ли получится.
Конфигурационный файлы редактировать нужно как минимум в NotePad++.

синтаксис и это всё нормально, просто когда закидуешь его обратно перезапукскаешь сервер, изменения не сохраняются, точнее их как будто и не было

sublime и NotePad++ редактирую и результат один и тот же

Такое может быть только из-за нарушения синтаксиса, при перезапуске майнкрафт создаёт новый конфиг, потому, что тот который вы отредактировали, он не понимает.

Какой именно конфиг вы редактируете?

config.yml

я банально пишу вместо true false
оно не хочет

config.yml - какого плагина?

config.yml от плагина, какой ему нужен синтаксис?